Ang “Shinjuku Onsen” ay hindi karaniwang kilala bilang isang hiwalay na lugar ng hot spring resort sa Japan tulad ng mga lugar na gaya ng Hakone o Kusatsu. Sa pangkaraniwang gamit, ang pangalan ay malamang tumutukoy sa mga pasilidad para sa paliligo sa loob o paligid ng Shinjuku, isa sa mga pinakaabalang urban district ng Tokyo, sa halip na sa isang tradisyonal na bayang onsen na may malinaw na sentro, tanawin ng mga kalye, o matagal nang itinatag na atmospera ng resort.
Gayunpaman, may sariling alindog ang ideya ng pagbabad sa Shinjuku. Ang paliligo rito ay magiging bahagi ng araw-araw na ritmo ng lungsod: isang paghinto sa pagitan ng mga linya ng tren, neon, mga hapunang gabi na, at ng tuluy-tuloy na galaw ng isa sa mga pinakasiksikang kapitbahayan ng Tokyo. Ang mga manlalakbay na interesado sa kultura ng paliligo ay maaaring makakita ng mga pampublikong paliguan o mga pasilidad na parang spa sa mas malawak na lugar, ngunit pinakamainam na suriing mabuti ang bawat lugar, dahil hindi lahat ng paliguan sa Tokyo ay tunay na onsen.